Desde el año 2003 conscientes de la importancia histórica de los fondos depositados en los distintos archivos municipales de la Isla, el Centro ha estado colaborando con ellos para desarrollar programas de preservación y de intervención puntual en algunas obras. El trabajo se ha realizado de manera multidisciplinar intentando dar razones para la mejora de los espacios existentes, con la adecuación de las dependencias y con controles físico-ambientales.
En este campo de acción se han visitado los fondos de los Archivos Municipales de Santa Cruz de La Palma, El Paso y Santo Domingo de Garafía, entre otros. Seleccionando e interviniendo en muchos de sus fondos que presentaban graves procesos degradatorios, sirva de ejemplo el Libro de Pósitos Agrícolas de 1593, el Libro de Actas de Sesiones de 1812, el Libro de Cuentas de la Ermita de Nuestra Señora de la Piedad (1602-1706) y diferente documentación perteneciente al Fondo Mendoza del Archivo de Los Llanos de Aridane; así como ya dos libros pertenecientes al fondo de los Antiguos Pósitos Agrícolas del Ayuntamiento de Los Sauces (1690-1838) y (1790) respectivamente. Otro material intervenido diferente a los fondos bibliográficos, fue la actuación realizada en el Archivo Municipal de la Villa y Puerto de Tazacorte sobre el Expediente de Segregación de 1925 y toda su documentación anexa.
La colaboración es abierta y satisfactoria dando excelentes resultados en la preservación de los mismos.